De Invoeringswet Wabo past meer dan 40 wetten aan voor de komst van de Wabo en bevat het overgangsrecht. Daarnaast bevat de Invoeringswet een aantal wijzigingen van de Wabo zelf, om ervoor te zorgen dat de tekst van de Wabo op het moment van inwerkingtreding volledig en actueel is.

Het gaat daarbij onder meer om (technische) aanpassingen in verband met andere in voorbereiding zijnde of in werking getreden wet- en regelgeving, zoals de Wet samenhangende besluiten, de Waterwet, de implementatie van de Europese dienstenrichtlijn etc.
 
De Wabo leidt tot aanpassingen van en het schrappen van veel artikelen in de bestaande wetgeving (onder meer Wet milieubeheer, Woningwet, Wet ruimtelijke ordening en Monumentenwet). Zo zal vanwege het aanhaken van de vergunning ingevolge de Natuurbeschermingswet 1998 en de ontheffing van de Flora- en faunawet bij de omgevingsvergunning bijvoorbeeld ook de betreffende natuurbeschermingswetgeving worden aangepast.